講堂 書院中最主要的建築為講堂，它多座落在書院建築群的中央，前後左右環繞著其他配屬的建物。簡單而言，講堂就是最主要的教室，主持的山長或所聘的老師即在此傳道、授業、解惑。

鳳儀書院講堂面寬三開間，進深用五根柱子，屋架為十一架，採「徹上露明造」，即是可以見到整座棟架的細節，而不作天花板。架內施三通五瓜式，指三根通梁與五個瓜筒之棟架，但最上層瓜筒卻以斗座代替，這是台灣常用的技巧。

瓜筒圓胖屬較簡潔的形式，不施長瓜腳，即所謂「趴瓜」，瓜腳作鴨蹼狀，稱為鴨蹄。棟架上有較多的雕花材並施以彩繪及撒螺片，如：束隨飾琴棋書畫、頭巾與瓜串飾花草、二通隨飾螭龍。
值得特別注意的是前步口柱員光屐作巨大的關刀栱，不施吊筒，這點與頭門是有別的。

講堂為敞廳式，前面不裝格扇門窗，但背後有格扇，成為供桌的背屏。清代原應有供桌，至於所供奉之神明為何？未見於盧德嘉的采訪冊，但講堂東壁原嵌「鳳儀崇祀五子並立院田碑」，或可推測為五子。另外，講堂講堂屋脊現只剩下龍形鐵製骨架，曲線極優美，推測原來可能為水龍之泥塑剪黏脊飾。